Strukturen til LFS følger Linux standarder så tett som mulig. De primære standardene er:
Linux Standard Base (LSB) Version 5.0 (2015) var ment å sikre at binære programvarepakker kan installeres og kjøres på en kompatibel systemet, men det er nedlagt nå. I dag er det ikke praktisk å bygge en system som tilfredsstiller de gamle LSB kravene, og en binær programvare pakke sendes vanligvis i en form som inneholder alle de nødvendige tredjepartskomponenter (kanskje bortsett fra veldig grunnleggende og bevarte som glibc, bash eller coreutils), for eksempel en tarball som inneholder alle komponentene, en statisk koblet kjørbar, eller en lettvekter containerbilde som AppImage eller Flatpak, i stedet for å stole på LSB hvis det er ment å være distroagnostisk. LFS redaktører hadde brukt LSB som en referanse tidligere, men nå i hele LSB er det bare kravet om den dynamiske linkerbanen som vurderes seriøst (i Seksjon 5.5, «Glibc-2.44» noen symbolkoblinger vil bli opprettet for krav).